Chức năng, nhiệm vụ của Ban quản lý các khu công nghiệp tỉnh Sơn La thực hiện theo Thông tư liên tịch số 06/TTLT-BKHĐT-BNV ngày 03/09/2015 và Quyết định số 06/2017/QĐ-UBND ngày 20/01/2017 của Ủy ban nhân dân tỉnh Sơn La.